実は昨日より、新しいほうのPC（SONY VAIO PCV-RX72K）で書いています。
古いほう（富士通 FMV-DESKPOWER M5/8074）はデータの抜き出しが終了しました。
設定もほぼ同じにしました。
※FMVに無駄に入れていたソフトはVAIOには入れなかったのでさくさくです。
メモリはVAIOは1G。FMVは512MB。
…これだけでも随分違いますが。
で、あとはFMVの初期化をやればおしまいです。
使っているうちに変な挙動をするPCになったので、解消されればいいなぁ、とか。